ハンタウイルスゲノムは米軍バイオラボで「ヒトの血液」から作られた
2026年5月15日 ショーン·アドル·タバタバイ
ハンタウイルスゲノムは、2020年のニューイングランド医学ジャーナル（NEJM）論文に関連する付録文書とGenBankの発表された記録によると、米軍バイオラボフォートデトリックの「ヒトの血」から構築された。
アンデスハンタウイルスのゲノム配列は、コンピューター·アセンブリー·ソフトウェアと参照ゲノム·フィルインを用いて、ヒトの血液から抽出された断片的な配列解読から、悪名高い施設で組み立てられた。
Modernity.news レポート: この論文の資金開示は、フォート·デトリック·ハンタウイルスのゲノム再構築作業が、バッテル記念研究所とローリマ政府ソリューションズが参加する契約を含む、HHS/NIAID（HHSN272201800013CとHHSN272200700016I）に関連する米国政府の生物防衛および感染症資金調達チャンネルを通じて支援されたことを示している。
2つのFort Detrick/NIAID契約に割り当てられた潜在的資金の合計は、約3億8750万ドルです。
記録によると、アメリカ陸軍感染症医学研究所（USAMRIID）の科学者たちは、ハンタウイルスとされる患者から血液サンプルを物理的に受け取り、これらのサンプルを使ってGenBankに現在保存され、科学文献全体に引用されているゲノム配列を生成したと言われている。
同じフォートデトリックが建造したアンデス·ハンタウイルスゲノム配列は、最近クルーズ船MVホンディウスで発生した2026年のハンタウイルスに関連する配列を分析し、比較するための参考ゲノムとして現在研究者によって使用されている。
PCR検査、発生追跡、検疫政策、監視システム、ワクチン開発を推進する基礎ゲノム配列が、精製されたウイルス分離株の直接的な中断のない配列決定ではなく、コンピュータの再構築、統計モデリング、参照配列の注入に大きく依存している場合には、 パンデミック対応の枠組み全体がますます循環的で自己refe的になっているかどうかについて、深い疑問を投げかけている。
なぜなら、基準シーケンス、計算パイプライン、診断基準を制御する者は、アウトブレイクが検出され、モデル化され、宣言され、応答される基盤を効果的に制御するからだ。
フォート·デトリックがヒトの血液サンプルを受け取った
NEJM論文補足付録では、「エピエンANDVによるハンタウイルス肺症候群の発生による28例（34例中82%）の全血サンプルがゲノム解析に含まれていた」と明示している
研究者たちはさらに、「RNAは400 µlの全血から抽出された
付録ではまた、サンプルはフォートデトリック軍事生物防衛システムに物理的に移送されたと述べている。「サンプルは物質移送契約（MRMC管理番号:W81XWH-18-0469）に基づいてUSAMRIIDに発送された。」
つまり、公開されたハンタウイルスゲノムは、米軍のバイオラボパイプライン内で処理された混合血液サンプルから直接抽出された断片的なRNAシークエンシング読み取りから生成された。
ゲノムを構築する前にヒトの遺伝物質を除去したと科学者が言う
この記録によると、フォート·デトリックの科学者たちは、精製されたウイルス粒子から完全な連続したハンタウイルスゲノムを直接配列しなかった。
代わりに、次のようなワークフローが関係しています:
ヒトの血液から混合遺伝物質を抽出し、
人間の配列を計算的に削除すること、
断片的な配列解読をコンティッグと呼ばれる部分ゲノム断片にまとめる、
GenBankから以前に発表された参照シーケンスを使用して、不足しているゲノムギャップを埋める。
付録では、「ヒトゲノムとヒト転写体の読み取り除去は、その後、品質管理された読み取りをヒトゲノム基準GRCh38に合わせることによって行われた
つまり、フォート·デトリックの科学者たちは、血液由来のシークエンシングデータから人間の遺伝物質を最初にろ過した後、残りの断片をアンデスハンタウイルスのゲノムに組み立てたと主張している。
しかし、原材料は直接配列された精製ウイルス分離株ではなく、ヒトの血液由来配列決定フラグメントを混合したものであったため、最終的に発表されたゲノムは、最終的に「ハンタウイルス」配列としてカウントされるものを決定するために、依然として計算解釈、再構成決定、参照ガイド付きフィルインに依存していた。
最終的に発表されたゲノムは、単純に精製されたウイルス粒子から「直接」読み取られたものではなかった。
これは、フォート·デトリックの生体情報パイプライン内で実行された、コンピュータ駆動のフィルタリング、再構築、統計的コンセンサス·コール、参照シーケンス·パッチの多層化によって明らかになった。
公開されたゲノムは、参照シーケンスを使用して一緒にパッチされた
付録では、ゲノムがどのように組み立てられたかを説明しています:「ANDVコンセンサスゲノムを生成するために、クリーンな読み取りはSPAdesを使用してdevovoで組み立てられました...」
しかし、シーケンシングデータは、患者の血液サンプルから直接完全な連続ゲノムを生成するものではなかった。
その代わりに、研究者たちは、ゲノムの欠落した部分は、以前に発表されたゲノム配列を使って埋めなければならないことを認めた:「不完全なコンティグのギャップと端は、GenBankの近い完全なゲノムセグメントからの配列で埋められていた...」
つまり、最終的に発表されたハンタウイルスゲノムの一部は、直接配列決定データが欠落または不完全な古い基準ゲノム配列を使用して一緒にパッチされた。
付録では、「Q20以上のPhred品質スコアを持ち、最低3倍のカバレッジを持つベースのみがコンセンサスコールに使用された」と述べている
コンセンサス·コーリングは、フィルタリング、アライメント、再構築後の断片化されたシーケンシング読み取りから「最適な」ゲノム配列を生成するコンピュータ·プロセスである。
もし、発表されたハンタウイルスゲノムの一部が欠落し、古い参照配列を使って埋めなければならなかったとしたら、最終的なゲノムのどれが患者の血液から直接配列され、コンピューターで生成された再構成はいくらだったのだろうか？
一部のゲノムセグメントは半分以上欠落していた
さらに、この記録は、再構築と参照フィルインが適用される前に、いくつかのゲノムアセンブリが実質的に不完全であったことを明らかにしている。
表 S3 に、「3080/6562 [46.94%]」の対象範囲のみを示します
つまり、追加の再構築と参照ゲノムフィルインが発表されたシーケンスを完了するために使用される前に、ゲノムセグメントの半分以上が欠落していたことになる。
他の患者サンプルははるかに高いカバレッジを達成し、多くは99%に近づいているが、付録では不完全なコンティグと欠損ゲノム領域がアセンブリのワークフローの繰り返しの一部であったことを確認した。
つまり、発表されたハンタウイルスゲノムの一部は、患者の材料から直接配列されたものではなく、元のゲノムデータが欠落しているところで計算的に再構築され、パッチが当てられたものである。
このことは、最終的に発表されたゲノムの精度と信頼性に大きな疑問を投げかけている。なぜなら、いくつかの配列のかなりの部分が欠落し、後に患者材料から直接配列されるのではなく、コンピュータベースの参照フィルインによって再構成されたからである。
PCRプライマーもヒト遺伝物質と一致
発表されたハンタウイルスPCRプライマーと蛍光プローブがヒトの遺伝物質と繰り返し一致することを示す最近のBLAST分析とともに、この発見の意義はさらに大きくなる。
分析によると: 「ハンタウイルスを検出するためにPCR検査によって使用された遺伝子配列の一部も、ヒトのDNA配列と直接一致しています
この報告書は、次のように繰り返し文書化されています:
19/19 完全試合制、
20/20 完全試合、
18/18の試合結果、
そして、ハンタウイルスPCR成分とヒトゲノム領域との間の数多くの17/17完全一致。
「陽性」PCR信号を生成するコンポーネントである蛍光検出プローブ自体も、正確かつほぼ正確なヒトDNAの一致を繰り返した。
この発見は、フォート·デトリックのワークフローに照らして特に重要になる。デトリックのワークフロー自体は、ヒトの血液サンプルの混合から始まり、ゲノムが組み立てられる前にヒトの遺伝物質の計算的減算を必要とした。
この重複は、公表された基準ゲノム自体が混合されたヒト血液由来のシークエンシングデータから再構築されたとき、PCRシステムがハンタウイルス遺伝物質というものとヒト遺伝物質をどれだけ自信を持って区別できるかについて、明らかな疑問を投げかけている。
DARPA文書がデジタルのみのウイルス配列のためのペンタゴンフレームワークを明らかに
Fort Detrickhantavirusの再構築のワークフローは、以前にリリースされたDARPA文書にも合致しており、ペンタゴンが支援するシステムは、「電子ウイルス配列情報のみが利用可能」である場合でも動作するように設計されている
DARPA レコードには、次の目的で設計されたシステムが記載されています:
デジタルゲノム配列を解析し、
感染性クローンゲノムを合成し、
ウイルスを細胞内で増殖させ、
そして、アップロードされた遺伝子配列をmRNA対策に迅速に変換する。
このプラットフォームは、物理的なウイルスが存在せず、コンピュータファイルだけが存在する場合でも動作するように設計されています。
ファイルには次のように記載されています:「パンデミック発生時には、電子ウイルス配列情報しか入手できない可能性を認識しているからです
GenBankのエントリーがハンタウイルスゲノムのヒトの血液起源を確認
今回の発生に関連するGenBankのエントリーは、発表されたゲノムを生成するために使用される生物学的ソース材料を独立して確認するものである。
エントリの状態: /isolation_source="whole blood"
GenBankのメタデータには、ゲノムを生成するために使用されるコンピュータアセンブリパイプラインもリストされている:
レイ
ボウタイ2
ピカール
Prinseq-lite
カット適応
イルミナ配列決定
NEJMの付録とGenBankの記録には、以下のことが記載されていません:
無傷のウイルス粒子の浄化、
プラーク分離、
シークエンシング前のウイルス培養精製、
または精製されたビリオンの直接的な配列決定。
代わりに、発表されたアンデスハンタウイルスゲノムは、人間の遺伝物質が計算的に除去され、以前に発表された参照ゲノム配列を使用して失われたゲノム領域が埋められた後、ヒトの血液から抽出された断片的な配列解読からデトリック砦で組み立てられたことを示す記録である。
収益
この記録は、精製されたウイルス粒子の直接的な中断のない配列決定ではなく、断片化された混合生物材料から生成され、参照誘導アセンブリパイプラインを通じて補足される計算的に再構成されたゲノム配列を中心に、生物学的防御とアウトブレイク応答フレームワークがますます中心になっていることを示している。
コンピュータで組み立てられたコンセンサスゲノムは、その後、以下のための基礎となる:
PCR テスト、
系統発生的モデリング、
伝送マッピング、
生殖数の計算、
アウトブレイク追跡、
検疫ポリシー、
監視システム、
ワクチンまたはmRNA対策の開発。
言い換えれば、フィルタリングアルゴリズム、参照シーケンスフィルイン、統計的コンセンサスモデリングによって組み立てられた同じコンピュータ生成ゲノム構造は、後にアウトブレイク·レスポンス·インフラそのもの全体の権威ある生物学的基礎として扱われる。
現在、この枠組みは、政府がホンディウス号の乗客に対して課した主流のメディアメッセージや権威主義的な検疫措置を正当化するために使用されている。
https://thepeoplesvoice.tv/hantavirus-genome-was-built-from-human-blood-at-u-s-military-bioloab/
